﻿494
www.psychiatriepropraxi.cz55071590190116234353373461519589658741771841886932964103911251171125213391384145615251557158316521719
/558771590190101
Psychiatr.572371590190125182252321404434504549595614
praxi63727159019089134206275306
2020;67137159019079153224298324
21(e3):70727159019078145175246321356380
e3–e1474877159019077152232312375441
/796471590190101
PSYCHIATRIE810071590190127201283370471506599664748784859
PRO89977159019081160269
PRAXI93047159019081160258350384
e797617148020186172
PŘEHLEDOVÉ7800294022710822132545755665778992410431145
ČLÁNKY89852940227108206333462582704
Klinický5200508018859114143214243302363431
význam5659508018864131189261330424
genetického6111508018866120192246304333393454509581651
testování6788508018855110169225291356418489518
u7334508018868
pacientů7431508018858120177206260332387459
s7916508018856
poruchou8000508018858129190261320391462533
autistického8561508018867135190220275331360420481537608678
spektra9265508018856115169231289351423
informace550970019033119160245293425498570646
na1233970019092164
nukleotidové1435970019091176243280358446494528615701773850
úrovni.2322970019091138222293381414442
Změny2802970019092222301386455
párů3300970019088162209295
bází3638970019089163229264
(pb)3939970019048138227265
adeninu4242970019078166245330363449533
(A),4812970019049142184208
thyminu5501190019049135204337370455540
(T),11271190019049130180204
cytosinu13681190019078154210293353385470555
(C)19601190019049137183
a21811190019079
guaninu23001190019087172244330363448532
(G)28701190019049145186
v30941190019079
genetické32101190019094173258337387420492559636
informaci38841190019040125167251299432504577610
člověka45311190019078112197269346413489
(DNA,5501410019042146249342373
deoxyribonukleotidová965141001908716525332139744648056865674382789493110101097114611791267135314241498
kyselina)25011410019072149209288322355440513552
jsou3090141001903997183269
nezbytným34011410019086165231321391447533601734
zdrojem41731410019069154202285319397528
variability473914100190771511982325501630019073161195229261311388
mezi98816300190131210276311
jedinci.13361630019048126215248333406439467
Na185416300190102175
druhou206616300190100147233319405491
stranu25951630019072124172246332416
některé30481630019099178245301376423500
tyto35851630019063139195278
změny39001630019078210289374443
způsobují43801630019078167253311398487573607640
produkci5501850019091141228321408478551586
chybně11761850019088177248341431513
sestaveného17281850019076158221275351425505594676765854
proteinu262218500190105156243294372407496583
nebo324518500190103185276367
jeho36521850019050131220310
nadprodukci400118500190103179270361412499591679749822857
či48971850019089123
absenci.5502070019073161221299385457490519
K11062070019093
zachycení12362070019078153225311379450525611644
těchto19182070019062137211296344427
změn23822070019077210288374
se27932070019073152
dnes298220700190100186264324
používá334420700190101189274340374447521
NGS391620700190102202277
technologie42302070019063138212297383469504590679712790
(next5502290019042124202273328
generation9162290019094173258337384458507540626712
sequencing).16662290019067146235319398484556589674762803826
Tato25302290019082143192275
metoda,285022900190131210259342431504532
díky34202290019094127198275
své37322290019068142219
kapacitě39892290019075150239313385418468543
a45702290019080
rychlosti,468822900190491261962825502510019034120179231265292
umožňuje8802510019085216302366452537570648
analýzu15662510019073159231265336406492
sérií20952510019061139187221254
vybraných23862510019073151240288363448517587673
genů30972510019087165251335
(panelové34702510019043132206292370405491562639
sekvenování),41472510019060139207285362448534605680765798849873
všech5502730019072132211284370
kódujících9572730019066150239324358391462495566652
regionů16462730019045122211244330416500
DNA218227300190103206299
(celoexomové25192730019040106182216302382453537669755827904
sekvenování,34602730019058137204283360445532603677763796823
WES)431927300190131207283325
nebo46802730019085164252340
i5502950019033
celého6212950019074149183262348434
lidského1092295001903770157216283359445532
genomu16632950019087166252338470554
(celogenomové225529500190451111872213073964755606467788659361013
sekvenování,33062950019062141209287364450536607682767800828
WGS)417329500190132230305347
(45).45572950019045119192233256
Výběr7703170019083156246326372
genů117831700190101180265349
do156431700190101187
panelového178731700190102176262340374459531607693780
sekvenování26033170019073152219297374460546617691776808
je34483170019047125
založen36093170019078153186272335411496
na41423170019099171
dosavadní435031700190101187246320390464552638670
znalosti5503390019064149219250333390439470
jejich10553390019029105135166235318
funkce.14083390019036121204269336409433
Vybírány18703390019082152239271315387470536
jsou2441339001902884168251
zejména27213390019065138169297373457526
geny,32773390019087163246311329
které36363390019067120193237311
byly39773390019088155188257
již4269339001902959122
dříve44203390019087131163233307
asociované475733900190721292135503610019071102185254326409486
s10713610019055
rozvojem11613610019043124184261343374450579
PAS,17703610019080161236261
např.20623610019085155241286302
v23953610019072
rámci25023610019047119248318348
strukturálních28853610019056105150234299352435480551583665696765848
změn37633610019065195271354
chromozomu,41483610019071154198280409493554635765847872
nebo5503830019085161247331
na9113830019085155
základě10953830019064137202236305390465
jejich15953830019029104135165234316
role19463830019042123155230
při22063830019088133164
vývoji23993830019072147223305336366
a27953830019072
správné29023830019058143188260327412488
funkci34243830019037121204268335366
mozku381938300190131214274340423
(46,42773830019037108186211
47).45183830019077146187207
Tyto47553830019074132185265
série5504050019060136181213288
zahrnují8734050019071144227272356438470500
řádově14084050019054125211294364438
stovky18814050019066115196265332406
genů23284050019087163246328
a26914050019079
jejich28054050019034110141172241324
záchytnost31644050019071144214297363416500584641691
se38904050019066142
pohybuje40734050019088174258324412495527602
mezi471640500190131208272304
5,7–26,8%5504270019078100175245313385411491629
(48,12144270019044115194220
49,14714270019078150169
50).16774270019078152191212
Celková19254270019092165197261343412484
výtěžnost24444270019074149203275339423507564614
testu30934270019051124182231314
je34424270019036112
závislá35894270019066139208240296327396
na40224270019086156
výběru42134270019074149236314358442
genů46924270019087163247328
i5504490019034
na6204490019087158
klinickém8144490019080115147231262333399474605
projevu145444900190102148231263340412497
pacienta.198744900190101174245277354438485557585
I26084490019046
zde26904490019065150227
byla295344900190102170204275
prokázána326444900190101148231298372437512596667
vyšší39674490019085162221278309
záchytnost43124490019077151222307374429514599657708
u5504710019085
pacientů6704710019088160230261336420465548
s12534710019058
kombinací13474710019066148278363395478548618649
PAS20304710019080161235
a22994710019073
dalšími24064710019087157189244274403433
klinickými28744710019067102132215245315380454584615
jevy35244710019034109179254
zejména38134710019064138169297373457527
s43754710019059
mentální446847100190131207290336407439521552
retardací5504930019047121168240284368438508538
(49).11234930019043114186223244
K7705150019079
analýze8835150019072154222253321387460
celého13715150019071143174249331414
genomu18135150019087161243326454535
pacientů23765150019088159227257332414458540
lze2950515001902889162
použít31415150019087171253315346393
přístup35635150019087132162217266348432
celoexomového40245150019070142173255332399479607690758832914996
sekvenování5505370019060136202277352435519588660743774
(WES)13595370019051185258332372
nebo17665370019095171257342
celogenomového2143537001908015318526935643251559972881288295610401124
sekvenování33025370019068145210286361444528597669752782
(WGS).41195370019052185281353393414
U457753700190100
pacientů471253700190881602302615505590019078161206289
s8745590019068
PAS9785590019080161235
je12485590019043119
výtěžnost14025590019081156209282345430514571620
těchto20575590019058131202285331411
postupů25125590019088173231280363449532
o30795590019094
3,7–9,2%32085590019078102177246322341420558
vyšší38015590019081156214270301
než41375590019094170234
u44065590019094
panelového453555900190881602433203524355505810019072147230314
sekvenování8995810019061137203279353436520590661744775
(51,17095810019043116182198
52,19435810019078150175
53).21535810019078150185206
Stanovení23955810019074118190273357426500584614
klinického30445810019069103134216247316381456539623
významu37035810019072147214299369497579
nalezených43185810019086156187263327401485551619702
nukleotidových5506030019086168233267343428474506591674744818887970
změn15556030019063193269352
je19426030019034109
založeno20866030019064137168252313387470554
na26746030019086156
mnoha286460300190131214298382452
faktorech,33516030019041114179232313358432503586612
např.39976030019086156241287302
na43336030019086156
dopadu45236030019087171258330415497
zachycené5506250019064137207290356424497580656
změny12366250019064194270353419
na16856250019085155
protein,18706250019088134215261334365447472
na23726250019086156
znalosti25576250019065149219250334391440471
genů,30586250019087163246328352
v34406250019072
nichž35426250019086116185268331
se39036250019060136
změna40696250019064194270353423
nachází,45216250019086156225308378442474499
na5506470019086156
původu7456470019088172242324411493
této12736470019054127174255
změny15636470019068198274357423
(zděděná20216470019047110193269355431514584
od26446470019086172
rodiče/28516470019052133220251320393449
de32896471019080146
novo34676471019083161226302
),3764647001904264
zda38636470019069152222
leží41206470019038114178210
na43696470019085155
X45636470019088
chromozomu4686647001907515820328455066900190131215276357486569
(zejména11546690019042105179210338414498568
u17576690019085
chlapců)18776690019071154186255341412495530
atd.24426690019073119201228
(54,27056690019042115192216
55).29566690019078148186207
Analýza5440970019092174243273341406478
TRIO,5946970019073153184288309
která6283970019067118190233304
vyžaduje6615970019071145210281365445476550
vyšetření7193970019071145201276322365438519549
probanda7770970019087132211296367448532601
a8399970019071
jeho8504970019033107189272
rodičů,8809970019041121206236304384408
je9251970019028102
účinným938197001908415218226352201190019086152282
nástrojem55321190019086156213263308389421497625
ke61871190019068142
stanovení63641190019055105176259343412487570601
původu69951190019088172242324411493
pozorovaných75191190019088173234315361442511583666732800883
změn84321190019065195271354
u88161190019085
pacienta.89361190019088160230261336419465536563
Až95291190019094161
u52201410019085
8053401410019078155
%552914100190117
pacientů56801410019088160230260336419465547
s62621410019058
PAS63551410019081161236
jsou6626141001903288172255
nukleotidové69151410019085167232267343428474505590674743818
změny77681410019062192268351417
pozoroványde8219141001908817323431536144251158366673289841411019080146
novo91581411019082160225301
(51,94941410019041113180196
56).52201630019078153190211
Zbylé54711630019086172240273348
faktory58541630019047120185238318364439
jsou6328163001903995178262
analyzovány66251630019077161231262331398479549620703769
pomocí74341630019088174303387458489
expresních79581630019083151238283357415498528597680
studií,86731630019065114197283314344369
funkčních90771630019047132215280347430461530613
analýz,52201850019073156226257326393421
in56761850019034117
silico5828185001905989120151220300
predikcí61641850019088134208294325390458488
a66871850019073
klinických67951850019068102133215246315380455523606
studií74361850019060109192278308339
(57,78101850019042115187195
58,80401850019078153179
59).82541850019078147185206
Epigenetika52202281020279171207299382472555607642713792
Epigenetika54402510019073156187270344425500545575638710
se61772510019059134
zaměřuje63382510019064135260335377458488562
na69272510019085153
analýzu71082510019071152221251318383465
regulace76072510019040112197277307375443514
exprese81492510019076143227272344400474
proteinu,86512510019087131210255326356437517541
ke92192510019067139
které93862510019067118189232305
dochází52202730019087171243327397462494
bez574927300190101179243
chromozomální60282730019083167212294424508569651781852884967998
nebo70612730019098175261347
nukleotidové74432730019098181246281357443489521607691760835
změny83142730019076207284367434
genomu.87832730019099176260344474557584
Toto94022730019086160207288
odvětví52202950019085172243317364440472
genetiky57322950019087163246322370401466540
zahrnuje63072950019069142226270355437468544
sledování6886295001906495171258341411482566596
modifikace752229500190131215302333373406471544614687
histonů,82492950019085116172221302386468493
metylace878129500190131208255329362432502575
DNA939529500190104205295
a52203170019072
mikroRNA532131700190131161225272353432532622
(mikroribonukleotidová597731700190371601902553023824284595446287127938588929671051109711281212129513631434
kyselina).74403170019068141199275306336418487524544
Používané80133170019080159242304336406477559635
metody867731700190130206253332419487
se91933170019060135
liší9363317001902858113143
na95353170019085154
základě52203390019064137203237307393468
mechanismu,572533900190131207278361431515545601729811836
který65963390019069122195240315
je69463390019035111
potřeba70933390019089174220265339425497
sledovat,7625339001906191167254338407479525551
např.82133390019085155241286302
imunoprecipitační85503390019035163245328412499545619690721806838886957102711101140
čipové52203610019071100185269337410
technologie56643610019044116186267349432464546631662736
(ChIP-on-chip),64343610019036121202233310353439522569642723753838873894
metyl735636100190130205252324356
specifická77413610019059143219289319359391459523595
multiplexová836536100190129210241287318402434509576656724795
PCR91883610019080168244
(MS94663610019036154224
PCR),52203830019080169247286308
vhodně55633830019072157241328411487
upravená60853830019085171216288356431514584
aCGH67043830019073163254353
(60).70923830019043115192230251
U544040500190100
pacientů55754050019088159229259335418463545
s61504050019059
PAS62394050019080160234
je65084050019029104
klinická66424050019067101131214244313378451
analýza71224050019073156225257325392465
epigenomu76164050019078163195280355438522651733
prováděna83784050019088134215284355440516599668
v90764050019072
konkrétních9183405001906814923329834641946652204270019085116184266
případech55154270019088133165250321406481552634
syndromů61794270019059129214299343424552634
asociovaných68424270019072128212282313395464535617683750833
s77044270019059
PAS,77934270019080160233259
jako8086427001902998162244
jsou8364427001902984167250
Praderův–Williho864342700190801231942793553994825526307587918218528829641047
nebo52204490019086162248333
Angelmanův56004490019093177262338370498568651733804
syndrom.64394490019071142227313357439568595
Obě708044900190107195272
onemocnění73874490019097181257386470541624700783814
mohou824744900190131215300384467
vznikat87494490019084151235266331404450
ztrátou92344490019076129174246292372455
části52204710019071142199248279
genomu,55294710019086162245329458540565
ale61244710019072103179
i63384710019028
poruchou64014710019088173219302372455538622
metylace705247100190131207254328360430500573
DNA.765447100190103204294324
Autistická80074710019094174222253309358389458523596
porucha86324710019088173219303372455525
je91924710019028104
pozorována9325471001908817323431552204930019047128198269353423
až56784930019081145
v58584930019081
25%59744930019078154292
u63014930019094
Praderova-Williho6430493001908012319528135740248355262467280083386489592510081092
syndromu75574930019068139224310355436565648
a82404930019081
34%83564930019078155293
u86844930019094
Angelmanova88134930019094177263339371499569652736805877
syndromu52205150019060133219306352434566650
(30,59065150019055129205230
41,61725150019091157174
42).63825150019091162200222
Ačkoliv664051500190106175241324358389461
několik71375150019099176243326359391457
studií76305150019072122207294326357
prokázalo802351500190101148231298373438512544629
roli86885150019060143176208
epigenetiky89315150019091178211298375460537586618684759
v52205370019072
etiologii53265370019077124155237269352438469499
PAS,58545370019079160233258
v61415370019072
klinické62425370019067101131213244312377450
praxi67215370019088133204272303
se70535370019060135
tyto72235370019043117170249
metody750153700190131206253333419488
v80185370019072
širším8119537001905989132190220348
spektru84955370019060144221286338383466
neuplatňují89905370019086161243328360429475557638669699
(61,52205590019042114179195
62,54505590019078150175
63,56605590019078151175
64).58705590019078158194215
Diskuze522060120211118167241334435516607
Poruchy54406250019081166215304378466536
autistického60156250019089175227263323376411485554633721810
spektra68646250019075165247317374423499
(PAS)74026250019059141226305349
jsou77906250019049110198286
závažná81156250019080158230306374463538
neurovývojová869262500190102182269318404478557638725760848922998
onemocnění,52206470019085172251382469542629707793827855
která61126470019066121197245319
narušují64676470019085158206292351435469503
schopnosti70086470019057130215302391478565625677711
sociální77576470019057144218251323358443477
interakce,82716470019032117165241289363431502577604
komunikace89136470019065149281366452485553629701777
a52206690019072
představivosti53326690019088135211300358410483554589661745805857890
u62576690019084
pacientů63816690019088162234267344430477562
(1,69816690019039109128
2,71436690019078105
3,72836690019077104
4).74216690019078116139
Diagnostika759566900190103137209296381467527578612679754
PAS83846690019080162239
využívá86586690019071148235300334407481
nástrojů91736690019085158217268316399433517